27-04-2023
Бисульфитное секвенирование (Bisulfite sequencing) — это применение бисульфитной обработки к ДНК для определения паттерна метилирования.
Метилирование ДНК было первой описанной эпигенетической модификацией и поэтому наиболее изучено. У животных обычно метилирование заключается в присоединении метильной группы к пятому атому углерода остатка цитозина в составе динуклеотида CpG и влечет за собой снижение активности гена.
Бисульфитное секвенирование основано на том факте, что обработка ДНК бисульфитом превращает остатки цитозина в урацил, но не затрагивает остатки 5-метилцитозина. Дальнейший анализ сводится к различению однонуклеотидных полиморфизмов, и к разделению в сиквенсах цитозинов и тиминов.
Другие методы вместо обработки бисульфитом для различения метилирования аллелей предполагают специфическую по метилированию рестрикцию и иммунопреципитацию метилированной ДНК (MeDIP).
Для обзора подходов к анализу ДНК, обработанных бисульфитом, см. следующие обзоры.[1][2][3][4]
Бисульфитное секвенирование.
