Lt304888.ru

Туристические услуги

Рибозим типа hammerhead

22-07-2023

Вторичная структура фрагмента RZ+ рибозима NC_003540.
Трехмерная структура полного рибозима типа Hammerhead, выделенный из вида Schistosoma mansoni [1]

Рибозимы типа hammerhead — это малые саморазрезающие РНК, которые имеют консервативную последовательность и обнаружены у некоторых вироидов и ассоциированы с сателлитными РНК некоторых вирусов растений.[2]

Впервые рибозимы типа hammerhead были открыты у вириоидов растений, такие рибозимы катализировали сиквенс-специфичное разрезание фосфо-диэфирных связей в молекулах РНК благодаря специфической третичной структуре.[3][4] Вторичная структура напоминает головку молотка — англ. hammerhead.

Содержание

Саморепликация

Данный рибозим способен самореплицироваться. Репликация происходит по типу катящегося колеса[5]. РНК надрезается в точке начала катящегося кольца. К освободившемуся 3' концу этой цепи начинают пристраиваться свободные дезоксинуклеотиды. По мере удлинения дочерней цепи РНК 5' конец из материнского кольца вытесняется. Когда 3' и 5' концы встретятся в одной точке, синтез РНК прекращается и дочернее кольцо отделяется от материнского.

Ссылки

  • Вторичная структура рибозима Hammerhead  (рус.). Virtual Laboratory Wiki. — (изображения). Архивировано из первоисточника 19 марта 2012. Проверено 2009-15-10.
  • О незначимости энергетической оценки при моделировании РНК - исследование в Викиверситете, по моделированию третичной структуры на примере рибозима типа hammerhead

См. также

Примечания

  1. Tertiary contacts distant from the active site prime a ribozyme for catalysis». Cell 126 (2): 309–320. 10.1016/j.cell.2006.06.036. PMID 16859740.
  2. Forster AC, Symons RH (1987). «Self-cleavage of plus and minus RNAs of a virusoid and a structural model for the active sites». Cell 49 (2): 211-220.
  3. 10.1126/science.231.4745.1577.
  4. Hutchins CJ, Rathjen PD, Forster AC, Symons RH (1986). «Self-cleavage of plus and minus RNA transcripts of avocado sunblotch viroid». Nucleic Acids Res. 14 (9): 3627-3640.
  5. Viroids with hammerhead ribozymes: some unique structural and functional aspects with respect to other members of the group. // Biol. Chem.. — 1999. — Т. 380. — № 7-8. — С. 849-854.


Рибозим типа hammerhead.

© 2020–2023 lt304888.ru, Россия, Волжский, ул. Больничная 49, +7 (8443) 85-29-01