Полужирным шрифтом выделены таксоны, русские названия которых найдены в литературе^[2][3], остальные транскрибированы с латинского языка.

Царство Chromista

• Отдел Hyphochytriomycota — Гифохитриомикота
  • Класс Hyphochytriomycetes — Гифохитриомицеты
    • Порядок Hyphochytriales — Гифохитриевые
      • Семейство Hyphochytriaceae — Гифохитриевые
      • Семейство Rhizidiomycetaceae — Ризидиомицетовые
• Отдел Labyrinthista [syn. Labyrinthulomycota — Лабиринтуломикота, или сетчатые слизевики]
  • Класс Labyrinthulea [syn. Labyrinthulomycetes — Лабиринтуловые]
    • Порядок Labyrinthulales
      • Семейство Labyrinthulaceae
    • Порядок Thraustochytriales [syn. Thraustochytridiomycetes — класс Траустохитридиомицеты]
      • Семейство Thraustochytriaceae
• Отдел Oomycota — Оомикота
  • Класс Oomycetes — Оомицеты
    • Порядок Albuginales
      • Семейство Albuginaceae — Альбуговые
    • Порядок Lagenismatales — Лагенисмовые
      • Семейство Lagenismataceae
    • Порядок Leptomitales — Лептомитовые
      • Семейство Apodachlyellaceae
      • Семейство Ducellieriaceae
      • Семейство Leptolegniellaceae — Лептолегниелловые
      • Семейство Leptomitaceae — Лептомитовые
    • Порядок Myzocytiopsidales — Мизоцитиопсидные
      • Семейство Crypticolaceae — Криптиколовые
      • Семейство Ectrogellaceae — Эктрогелловые
      • Семейство Myzocytiopsidaceae
      • Семейство Pontismataceae — Понтисмовые
      • Семейство Sirolpidiaceae — Сирольпидиевые
    • Порядок Olpidiopsidales — Ольпидиопсидовые
      • Семейство Olpidiopsidaceae
    • Порядок Peronosporales — Пероноспоровые
      • Семейство Peronosporaceae
    • Порядок Pythiales — Питиевые
      • Семейство Pythiaceae — Питиевые
      • Семейство Pythiogetonaceae — Питиогетоновые
    • Порядок Rhipidiales — Рипидиевые
      • Семейство Rhipidiaceae
    • Порядок Salilagenidiales — Салилагенидиевые
      • Семейство Salilagenidiaceae
    • Порядок Saprolegniales — Сапролегниевые
      • Семейство Leptolegniaceae — Лептолегниевые
      • Семейство Saprolegniaceae — Сапролегниевые
    • Семейства класса Oomycetes, не отнесённые к порядкам:
      • Eurychasmataceae
  • Порядки отдела Oomycota, не отнесённые к классам:
    • Anisolpidiales
      • Семейство Anisolpidiaceae
    • Haptoglossales
      • Семейство Haptoglossaceae
    • Rozellopsidales
      • Семейство Pseudosphaeritaceae
      • Семейство Rozellopsidaceae
  • Семейства отдела Oomycota, не отнесённые к классам и порядкам:
    • • Lagenaceae

Царство Fungi

Отдел Ascomycota

• Отдел Ascomycota — Аскомикота, или сумчатые грибы

Классы Arthoniomycetes, Dothideomycetes

• • Класс Arthoniomycetes — Артониомицеты
    • Порядок Arthoniales — Артониевые
      • Семейство Arthoniaceae — Артониевые^[4]
      • Семейство Chrysothricaceae — Хризотриксовые^[5]
      • Семейство Melaspileaceae
      • Семейство Roccellaceae — Роччеллиевые^[4]
  • Класс Dothideomycetes — Дотидеомицеты^[6]
    • Порядок Acrospermales — Акроспермовые
      • Семейство Acrospermaceae
    • Порядок Botryosphaeriales — Ботриосфериевые
      • Семейство Botryosphaeriaceae
    • Порядок Capnodiales — Капнодиальные
      • Семейство Antennulariellaceae — Антеннуляриелловые
      • Семейство Asterinaceae — Астериновые
      • Семейство Capnodiaceae — Капнодиевые
      • Семейство Davidiellaceae — Давидиелловые
      • Семейство Euantennariaceae — Эуантеннариевые
      • Семейство Metacapnodiaceae — Метакапнодиевые
      • Семейство Mycosphaerellaceae — Микосферелловые
      • Семейство Piedraiaceae
      • Семейство Schizothyriaceae — Схизотириевые
      • Семейство Teratosphaeriaceae — Тератосфериевые
    • Порядок Dothideales — Дотидеальные, или Дотидеевые
      • Семейство Coccoideaceae — Коккоидеевые
      • Семейство Dothideaceae — Дотидеевые
      • Семейство Dothioraceae — Дотиоровые
      • Семейство Planistromellaceae — Планистромелловые
    • Порядок Hysteriales — Гистериальные
      • Семейство Hysteriaceae — Гистериевые
    • Порядок Jahnulales — Янулальные
      • Семейство Aliquandostipitaceae
    • Порядок Meliolales — Мелиолальные
      • Семейство Meliolaceae — Мелиоловые
    • Порядок Microthyriales — Микротириальные
      • Семейство Aulographaceae — Аулографовые
      • Семейство Leptopeltidaceae — Лептопелтидовые
      • Семейство Microthyriaceae — Микротириевые
    • Порядок Myriangiales — Мириангиальные, или Мириангиевые
      • Семейство Cookellaceae — Кукелловые
      • Семейство Elsinoaceae
      • Семейство Myriangiaceae — Мириангиевые
    • Порядок Patellariales — Пателлариальные
      • Семейство Patellariaceae — Пателлариевые
    • Порядок Pleosporales — Плеоспоральные, или Плеоспоровые
      • Семейство Arthopyreniaceae — Артопирениевые^[4]
      • Семейство Corynesporascaceae — Коринеспорасковые
      • Семейство Cucurbitariaceae — Кукурбитариевые
      • Семейство Dacampiaceae — Дакампиевые
      • Семейство Delitschiaceae — Деличиевые
      • Семейство Diademaceae — Диадемовые
      • Семейство Didymosphaeriaceae — Дидимосфериевые
      • Семейство Dothidotthiaceae — Дотидоттиевые
      • Семейство Fenestellaceae — Фенестелловые
      • Семейство Leptosphaeriaceae — Лептосфериевые
      • Семейство Lophiostomataceae — Лофиостомовые
      • Семейство Massarinaceae — Массариновые
      • Семейство Melanommataceae — Меланоммовые^[6]
      • Семейство Montagnulaceae
      • Семейство Mytilinidiaceae — Митилинидиевые
      • Семейство Naetrocymbaceae — Нетроцимбовые
      • Семейство Parodiellaceae — Пародиелловые
      • Семейство Phaeosphaeriaceae — Феосфериевые
      • Семейство Phaeotrichaceae — Феотриховые
      • Семейство Pleomassariaceae — Плеомассариевые
      • Семейство Pleosporaceae — Плеоспоровые
      • Семейство Sporormiaceae — Спорормиевые
      • Семейство Testudinaceae
      • Семейство Tubeufiaceae
      • Семейство Venturiaceae — Вентуриевые
      • Семейство Zopfiaceae — Зопфиевые
    • Порядок Trypetheliales — Трипетелиальные
      • Семейство Trypetheliaceae — Трипетелиевые
    • Семейства дотидеомицетов, не отнесённые к порядкам:
      • Argynnaceae — Аргинновые
      • Ascoporiaceae — Аскопориевые
      • Aspidotheliaceae — Аспидотелиевые
      • Brefeldiellaceae — Брефельдиелловые
      • Diporothecaceae — Дипоротековые
      • Englerulaceae — Энглеруловые
      • Eoterfeziaceae — Эотерфециевые
      • Epigloeaceae — Эпиглеевые
      • Eremomycetaceae — Эремомицетовые
      • Hypsostromataceae — Гипсостромовые
      • Koralionastetaceae — Коралионастевые
      • Lautosporaceae — Лаутоспоровые
      • Lichenotheliaceae — Лихенотелиевые
      • Mastodiaceae — Мастодиевые
      • Meliolinaceae — Мелиолиновые
      • Mesnieraceae
      • Micropeltidaceae
      • Microtheliopsidaceae
      • Moriolaceae — Мориоловые
      • Mycoporaceae — Микопоровые^[4]
      • Myxotrichaceae — Миксотриховые
      • Parmulariaceae — Пармуляриевые
      • Parodiopsidaceae — Пародиопсидовые
      • Phaneromycetaceae — Фанеромицетовые
      • Phillipsiellaceae — Филлипсиелловые
      • Phyllobatheliaceae — Филлобателиевые
      • Polystomellaceae — Полистомелловые
      • Protoscyphaceae — Протосцифовые
      • Pseudeurotiaceae — Псевдэуроциевые
      • Pseudoperisporiaceae — Псевдопериспориевые
      • Pyrenothricaceae — Пиренотриковые
      • Roesleriaceae — Реслериевые
      • Saccardiaceae — Саккардиевые
      • Seuratiaceae
      • Thrombiaceae — Тромбиевые
      • Vizellaceae — Визелловые

Классы Eurotiomycetes, Laboulbeniomycetes

• • Класс Eurotiomycetes — Эуроциомицеты
    • Порядок Arachnomycetales — Арахномицетовые
      • Семейство Arachnomycetaceae
    • Порядок Ascosphaerales — Аскосферовые
      • Семейство Ascosphaeraceae
    • Порядок Chaetothyriales — Хетотириевые
      • Семейство Chaetothyriaceae
      • Семейство Coccodiniaceae — Коккодиниевые
      • Семейство Herpotrichiellaceae — Герпотрихиелловые
    • Порядок Coryneliales — Коринелиевые
      • Семейство Coryneliaceae
    • Порядок Eurotiales — Эуроциевые
      • Семейство Elaphomycetaceae — Элафомицетовые
      • Семейство Thermoascaceae — Термоасковые
      • Семейство Trichocomaceae — Трихокомовые
    • Порядок Mycocaliciales — Микокалициевые
      • Семейство Mycocaliciaceae
      • Семейство Sphinctrinaceae — Сфинктриновые
    • Порядок Onygenales — Онигеновые
      • Семейство Ajellomycetaceae
      • Семейство Arthrodermataceae — Артродермовые
      • Семейство Gymnoascaceae — Гимноасковые
      • Семейство Onygenaceae
    • Порядок Pyrenulales — Пиренулевые^[4]
      • Семейство Celotheliaceae — Целотелиевые
      • Семейство Massariaceae — Массариевые
      • Семейство Monoblastiaceae — Монобластиевые
      • Семейство Pyrenulaceae
      • Семейство Requienellaceae
      • Семейство Xanthopyreniaceae — Ксантопирениевые
    • Порядок Verrucariales — Веррукариевые
      • Семейство Adelococcaceae — Аделококковые
      • Семейство Verrucariaceae — Веррукариевые^[4]
    • Семейства эуроциомицетов, не отнесённые к порядкам:
      • Amorphothecaceae — Аморфотековые
      • Eremascaceae — Эремасковые
      • Monascaceae — Монасковые
      • Strigulaceae — Стригуловые

• • Класс Laboulbeniomycetes — Лабульбениомицеты
    • Порядок Laboulbeniales — Лабульбениевые
      • Семейство Ceratomycetaceae — Цератомицетовые
      • Семейство Euceratomycetaceae — Эуцератомицетовые
      • Семейство Herpomycetaceae — Герпомицетовые
      • Семейство Laboulbeniaceae
    • Порядок Pyxidiophorales — Пиксидиофоровые
      • Семейство Pyxidiophoraceae

Класс Lecanoromycetes

• • Класс Lecanoromycetes — Леканоромицеты
    • Порядок Acarosporales — Акароспоровые
      • Семейство Acarosporaceae — Акароспоровые^[7]
    • Порядок Agyriales — Агириевые
      • Семейство Agyriaceae — Агириевые^[5]
      • Семейство Schaereriaceae — Шерериевые^[5]
    • Порядок Baeomycetales — Беомицетовые
      • Семейство Anamylopsoraceae — Анамилоспоровые^[5]
      • Семейство Baeomycetaceae — Беомицетовые^[7]
      • Семейство Trapeliaceae — Трапелиевые^[8]
    • Порядок Candelariales — Канделяриевые
      • Семейство Candelariaceae
    • Порядок Lecanorales — Леканоровые
      • Семейство Aphanopsidaceae — Афанопсидиевые^[5]
      • Семейство Arctomiaceae — Арктомиевые
      • Семейство Biatorellaceae
      • Семейство Brigantiaeaceae — Бригантиевые^[5]
      • Семейство Calycidiaceae — Калицидиевые
      • Семейство Catillariaceae — Катиляриевые^[8]
      • Семейство Cladoniaceae — Кладониевые
      • Семейство Crocyniaceae — Кроциниевые
      • Семейство Dactylosporaceae — Дактилоспоровые
      • Семейство Ectolechiaceae — Эктолехиевые^[5]
      • Семейство Gypsoplacaceae — Гипсоплаковые^[5]
      • Семейство Haematommataceae — Гематоммовые
      • Семейство Hymeneliaceae — Гименелиевые
      • Семейство Lecanoraceae — Леканоровые^[9]
      • Семейство Megalariaceae — Мегалариевые^[8]
      • Семейство Miltideaceae — Милтидеевые
      • Семейство Mycoblastaceae — Микобластовые^[5]
      • Семейство Parmeliaceae — Пармелиевые^[9]
      • Семейство Pilocarpaceae — Пилокарповые^[4]
      • Семейство Psoraceae — Псоровые^[5]
      • Семейство Ramalinaceae — Рамалиновые^[5]
      • Семейство Sarrameanaceae — Саррамеановые
      • Семейство Scoliciosporaceae — Сколициоспоровые
      • Семейство Sphaerophoraceae — Сферофоровые^[10]
      • Семейство Stereocaulaceae — Стереокаулоновые^[11]
      • Семейство Tephromelataceae — Тефромеловые
    • Порядок Lecideales — Лецидеевые
      • Семейство Lecideaceae — Лецидеевые^[12]
      • Семейство Porpidiaceae — Порпидиевые^[12]
    • Порядок Ostropales — Остроповые
      • Семейство Asterothyriaceae — Астеротириевые
      • Семейство Coenogoniaceae — Ценогониевые^[10]
      • Семейство Gomphillaceae — Гомфилловые^[5]
      • Семейство Graphidaceae — Графидовые
      • Семейство Gyalectaceae — Гиалектовые^[10]
      • Семейство Myeloconidiaceae — Миелоконидиевые
      • Семейство Odontotremataceae — Одонтотремовые
      • Семейство Phlyctidaceae — Фликтисовые^[5]
      • Семейство Porinaceae — Пориновые
      • Семейство Stictidaceae — Стиктидовые
      • Семейство Thelotremataceae — Телотремовые^[10]
    • Порядок Peltigerales — Пельтигеровые
      • Семейство Coccocarpiaceae — Коккокарпиевые
      • Семейство Collemataceae — Коллемовые^[10]
      • Семейство Lobariaceae — Лобариевые
      • Семейство Massalongiaceae — Массалонговые
      • Семейство Nephromataceae — Нефроматовые
      • Семейство Pannariaceae — Паннариевые^[10]
      • Семейство Peltigeraceae — Пельтигеровые^[10]
      • Семейство Placynthiaceae — Плацинтиевые
    • Порядок Pertusariales — Пертузариевые
      • Семейство Coccotremataceae — Коккотремовые
      • Семейство Icmadophilaceae — Икмадофиловые
      • Семейство Megasporaceae — Мегаспоровые
      • Семейство Ochrolechiaceae — Охролехиевые
      • Семейство Pertusariaceae — Пертузариевые^[9]
    • Порядок Rhizocarpales — Ризокарповые
      • Семейство Rhizocarpaceae — Ризокарповые^[8]
    • Порядок Teloschistales — Телосхистовые
      • Семейство Caliciaceae — Калициевые^[10]
      • Семейство Letrouitiaceae — Летруитиевые
      • Семейство Megalosporaceae — Мегалоспоровые
      • Семейство Microcaliciaceae — Микрокалициевые
      • Семейство Physciaceae — Фисциевые^[5]
      • Семейство Ropalosporaceae — Ропалоспоровые
      • Семейство Teloschistaceae — Телосхистовые^[13]
    • Порядок Umbilicariales — Умбиликариевые
      • Семейство Elixiaceae — Эликсиевые
      • Семейство Fuscideaceae — Фусцидеевые^[13]
      • Семейство Ophioparmaceae — Офиопармовые
      • Семейство Rhizoplacopsidaceae — Ризоплакопсидовые
      • Семейство Umbilicariaceae — Умбиликариевые^[7]
    • Семейства леканоромицетов, не отнесённые к порядкам:
      • Arthrorhaphidaceae — Артрорафидовые^[5]
      • Coniocybaceae — Кониоцибовые
      • Protothelenellaceae — Прототеленелловые
      • Thelenellaceae — Теленелловые

Классы Leotiomycetes — Orbiliomycetes

• • Класс Leotiomycetes — Леоциомицеты
    • Порядок Cyttariales — Циттариевые
      • Семейство Cyttariaceae
    • Порядок Erysiphales — Эризифовые, или настоящие мучнисторосяные грибы
      • Семейство Erysiphaceae
    • Порядок Helotiales — Гелоциевые
      • Семейство Ascocorticiaceae — Аскокортициевые
      • Семейство Dermateaceae — Дерматеевые
      • Семейство Geoglossaceae — Геоглоссовые
      • Семейство Helotiaceae
      • Семейство Hemiphacidiaceae — Гемифацидиевые
      • Семейство Hyaloscyphaceae — Гиалосцифовые
      • Семейство Loramycetaceae — Лорамицетовые
      • Семейство Phacidiaceae — Фацидиевые
      • Семейство Rutstroemiaceae — Рутстрёмиевые
      • Семейство Sclerotiniaceae — Склеротиниевые
      • Семейство Vibrisseaceae — Вибриссеевые
    • Порядок Leotiales — Леоциевые
      • Семейство Bulgariaceae — Булгариевые
      • Семейство Leotiaceae
    • Порядок Rhytismatales — Ритизмовые
      • Семейство Ascodichaenaceae — Аскодихеновые
      • Семейство Cudoniaceae — Кудониевые
      • Семейство Rhytismataceae
    • Порядок Thelebolales — Телеболовые
      • Семейство Thelebolaceae
    • Семейства леоциомицетов, не отнесённые к порядкам:
      • Thelocarpaceae — Телокарповые^[4]
      • Vezdaeaceae — Вездеевые^[5]
  • Класс Lichinomycetes — Лихиномицеты
    • Порядок Lichinales — Лихиновые
      • Семейство Gloeoheppiaceae — Глеогеппиевые
      • Семейство Heppiaceae — Геппиевые
      • Семейство Lichinaceae — Лихиновые^[10]
      • Семейство Peltulaceae — Пельтуловые
  • Класс Neolectomycetes — Неолектомицеты
    • Порядок Neolectales — Неолектовые
      • Семейство Neolectaceae
  • Класс Orbiliomycetes — Орбилиомицеты
    • Порядок Orbiliales — Орбилиевые
      • Семейство Orbiliaceae

Классы Pezizomycetes — Schizosaccharomycetes

• • Класс Pezizomycetes — Пецицомицеты
    • Порядок Pezizales — Пецицевые, или оперкулятные дискомицеты
      • Семейство Ascobolaceae — Аскоболовые
      • Семейство Ascodesmidaceae — Аскодсмидовые
      • Семейство Caloscyphaceae — Калосцифовые
      • Семейство Carbomycetaceae — Карбомицетовые
      • Семейство Chorioactidaceae — Хориоактидные
      • Семейство Discinaceae — Дисциновые
      • Семейство Glaziellaceae
      • Семейство Helvellaceae — Гельвелловые, или Лопастниковые
      • Семейство Karstenellaceae — Карстенелловые
      • Семейство Morchellaceae — Моршелловые, или Сморчковые
      • Семейство Pezizaceae — Пецицевые
      • Семейство Pyronemataceae — Пиронемовые
      • Семейство Rhizinaceae — Ризиновые
      • Семейство Sarcoscyphaceae — Саркосцифовые
      • Семейство Sarcosomataceae — Саркосомовые
      • Семейство Tuberaceae — Трюфелевые
  • Класс Pneumocystidomycetes — Пневмоцистидомицеты
    • Порядок Pneumocystidales — Пневмоцистидные
      • Семейство Pneumocystidaceae
  • Класс Saccharomycetes — Сахаромицеты
    • Порядок Saccharomycetales — Сахаромицетовые
      • Семейство Ascoideaceae — Аскоидеевые
      • Семейство Cephaloascaceae — Цефалоасковые
      • Семейство Dipodascaceae — Диподасковые
      • Семейство Endomycetaceae — Эндомицетовые
      • Семейство Eremotheciaceae — Эремотециевые
      • Семейство Lipomycetaceae — Липомицетовые
      • Семейство Metschnikowiaceae — Мечниковиевые
      • Семейство Phaffomycetaceae — Пфаффомицнтовые
      • Семейство Pichiaceae — Пихиевые
      • Семейство Saccharomycetaceae
      • Семейство Saccharomycodaceae — Сахаромикодовые
      • Семейство Saccharomycopsidaceae — Сахаромикопсидовые
      • Семейство Trichomonascaceae — Трихомонасковые
  • Класс Schizosaccharomycetes — Схизосахаромицеты, или делящиеся дрожжи
    • Порядок Schizosaccharomycetales — Схизосахаромицетовые
      • Семейство Schizosaccharomycetaceae

Классы Sordariomycetes, Taphrinomycetes

• • Класс Sordariomycetes — Сордариомицеты ^[6]
    • Порядок Boliniales — Болиниевые
      • Семейство Boliniaceae
      • Семейство Catabotrydaceae — Катаботридовые
    • Порядок Calosphaeriales — Калосфериевые
      • Семейство Calosphaeriaceae
      • Семейство Pleurostomataceae — Плевростомовые
    • Порядок Chaetosphaeriales — Хетосфериевые
      • Семейство Chaetosphaeriaceae
    • Порядок Coniochaetales — Кониохетовые
      • Семейство Coniochaetaceae
    • Порядок Coronophorales — Коронофоровые
      • Семейство Bertiaceae — Бертиевые
      • Семейство Chaetosphaerellaceae — Хетосферелловые
      • Семейство Nitschkiaceae
    • Порядок Diaporthales — Диапортовые
      • Семейство Cryphonectriaceae — Крифонектриевые
      • Семейство Diaporthaceae
      • Семейство Gnomoniaceae — Гномониевые
      • Семейство Melanconidaceae — Меланконидовые
      • Семейство Melogrammataceae — Мелограммовые
      • Семейство Pseudovalsaceae — Псевдовальсовые
      • Семейство Schizoparmaceae — Схизопармовые
      • Семейство Sydowiellaceae
      • Семейство Togniniaceae — Тоньиниевые
      • Семейство Valsaceae — Вальсовые
    • Порядок Hypocreales — Гипокрейные
      • Семейство Bionectriaceae — Бионектриевые
      • Семейство Clavicipitaceae — Клавицепсовые, или Спорыньёвые
      • Семейство Cordycipitaceae — Кордицепсовые
      • Семейство Hypocreaceae — Гипокрейные
      • Семейство Nectriaceae — Нектриевые
      • Семейство Niessliaceae — Нисслиевые
      • Семейство Ophiocordycipitaceae — Офиокордицепсовые
    • Порядок Lulworthiales
      • Семейство Hispidicarpomycetaceae — Гиспидикарпомицетовые
      • Семейство Lulworthiaceae
      • Семейство Spathulosporaceae — Спатулоспоровые
    • Порядок Melanosporales — Меланоспоровые
      • Семейство Ceratostomataceae — Цератостомовые
    • Порядок Microascales — Микроасковые
      • Семейство Ceratocystidaceae — Цератоцистидные
      • Семейство Chadefaudiellaceae
      • Семейство Halosphaeriaceae — Галосфериевые
      • Семейство Microascaceae
    • Порядок Ophiostomatales — Офиостомовые^[6]
      • Семейство Ophiostomataceae
    • Порядок Phyllachorales — Филлахоровые
      • Семейство Phaeochoraceae — Феохоровые
      • Семейство Phyllachoraceae
    • Порядок Sordariales — Сордариевые
      • Семейство Cephalothecaceae — Цефалотековые
      • Семейство Chaetomiaceae — Хетомиевые
      • Семейство Helminthosphaeriaceae — Гельминтосфериевые
      • Семейство Lasiosphaeriaceae — Лазиосфериевые
      • Семейство Sordariaceae — Сордариевые
    • Порядок Trichosphaeriales — Трихосфериевые
      • Семейство Trichosphaeriaceae
    • Порядок Xylariaceae — Ксиляриевые
      • Семейство Amphisphaeriaceae — Амфисфериевые
      • Семейство Cainiaceae
      • Семейство Clypeosphaeriaceae — Клипеосфериевые
      • Семейство Diatrypaceae — Диатриповые
      • Семейство Graphostromataceae — Графостромовые
      • Семейство Hyponectriaceae — Гипонектриевые
      • Семейство Iodosphaeriaceae — Иодосфериевые
      • Семейство Myelospermataceae — Миелоспермовые
      • Семейство Xylariaceae — Ксиляриевые
    • Семейства сордариомицетов, не отнесённые к порядкам:
      • Annulatascaceae
      • Apiosporaceae
      • Batistiaceae
      • Glomerellaceae
      • Kathistaceae
      • Magnaporthaceae
      • Obryzaceae
      • Papulosaceae
      • Plectosphaerellaceae
      • Thyridiaceae
      • Vialaeaceae

• • Класс Taphrinomycetes — Тафриномицеты [syn. Archiascomycetes — Археаскомицеты]
    • Порядок Taphrinales — Тафриновые
      • Семейство Protomycetaceae — Протомицетовые
      • Семейство Taphrinaceae

Порядки Ascomycota, не отнесённые к классам

• • • Lahmiales
      • Семейство Lahmiaceae
    • Medeolariales
      • Семейство Medeolariaceae
    • Triblidiales
      • Семейство Triblidiaceae

Отдел Basidiomycota

• Отдел Basidiomycota — Базидиомикота

Класс Agaricomycetes

• • Класс Agaricomycetes — Агарикомицеты
    • Порядок Agaricales — Агариковые
      • Семейство Agaricaceae — Агариковые, или Шампиньоновые
      • Семейство Amanitaceae — Аманитовые, или Мухоморовые
      • Семейство Bolbitiaceae — Больбитиевые
      • Семейство Broomeiaceae — Брумеевые
      • Семейство Clavariaceae — Клавариевые, или Рогатиковые
      • Семейство Cortinariaceae — Кортинариевые, или Паутинниковые
      • Семейство Cyphellaceae — Цифелловые
      • Семейство Entolomataceae — Энтоломовые
      • Семейство Fistulinaceae — Фистулиновые
      • Семейство Gigaspermaceae — Гигаспермовые
      • Семейство Hemigasteraceae — Гемигастеровые
      • Семейство Hydnangiaceae — Гиднангиевые
      • Семейство Hygrophoraceae — Гигрофоровые
      • Семейство Inocybaceae — Волоконницевые
      • Семейство Lyophyllaceae — Лиофилловые
      • Семейство Marasmiaceae — Негниючниковые
      • Семейство Mycenaceae — Миценовые
      • Семейство Niaceae
      • Семейство Phelloriniaceae — Феллориниевые
      • Семейство Physalacriaceae — Физалакриевые
      • Семейство Pleurotaceae — Плевротовые, или Вешенковые
      • Семейство Pluteaceae — Плютеевые
      • Семейство Psathyrellaceae — Псатирелловые [syn. Coprinaceae — Коприновые, или Навозниковые]
      • Семейство Pterulaceae — Птеруловые
      • Семейство Schizophyllaceae — Схизофилловые, или Щелелистниковые
      • Семейство Strophariaceae — Строфариевые
      • Семейство Tapinellaceae — Тапинелловые
      • Семейство Tricholomataceae — Трихоломовые, или Рядовковые
      • Семейство Typhulaceae — Тифуловые
    • Порядок Atheliales — Ателиевые
      • Семейство Atheliaceae
    • Порядок Auriculariales — Аурикуляриевые
      • Семейство Auriculariaceae
    • Порядок Boletales — Болетовые
      • Семейство Amylocorticiaceae — Амилокортициевые
      • Семейство Boletaceae — Болетовые
      • Семейство Boletinellaceae — Болетинелловые
      • Семейство Calostomataceae — Калостомовые
      • Семейство Coniophoraceae — Кониофоровые
      • Семейство Diplocystidiaceae — Диплоцистидиевые
      • Семейство Gasterellaceae — Гастерелловые
      • Семейство Gastrosporiaceae — Гастроспоровые
      • Семейство Gomphidiaceae — Гомфидиевые, или Мокруховые
      • Семейство Gyroporaceae — Гиропоровые
      • Семейство Hygrophoropsidaceae — Гигрофоропсидовые
      • Семейство Paxillaceae — Паксилловые, или Свинушковые
      • Семейство Protogastraceae — Протогастровые
      • Семейство Rhizopogonaceae — Ризопогоновые
      • Семейство Sclerodermataceae — Склеродермовые, или Ложнодождевиковые
      • Семейство Sclerogastraceae — Склерогастровые
      • Семейство Serpulaceae — Серпуловые
      • Семейство Suillaceae — Маслёнковые
    • Порядок Cantharellales — Кантарелловые, или Лисичковые
      • Семейство Aphelariaceae — Афеляриевые
      • Семейство Botryobasidiaceae — Ботриобазидиевые
      • Семейство Cantharellaceae — Кантарелловые, или Лисичковые
      • Семейство Ceratobasidiaceae — Цератобазидиевые
      • Семейство Clavulinaceae — Клавулиновые
      • Семейство Hydnaceae — Гидновые, или Ежовиковые
      • Семейство Tulasnellaceae — Туласнелловые
    • Порядок Corticiales — Кортициевые
      • Семейство Corticiaceae
    • Порядок Geastrales — Геастровые
      • Семейство Geastraceae
    • Порядок Gloeophyllales — Глеофилловые
      • Семейство Gloeophyllaceae
    • Порядок Gomphales — Гомфовые
      • Семейство Clavariadelphaceae — Клавариадельфовые
      • Семейство Gomphaceae — Гомфовые
      • Семейство Lentariaceae — Лентариевые
    • Порядок Hymenochaetales — Гименохетовые
      • Семейство Hymenochaetaceae — Гименохетовые
      • Семейство Schizoporaceae
    • Порядок Hysterangiales — Гистерангиевые
      • Семейство Gallaceaceae — Галлацеевые
      • Семейство Hysterangiaceae — Гистерангиевые
      • Семейство Mesophelliaceae — Мезофеллиевые
      • Семейство Phallogastraceae — Фаллогастровые
      • Семейство Trappeaceae — Траппеевые
    • Порядок Phallales — Весёлковые, или Фаллюсовые
      • Семейство Claustulaceae — Клаустуловые
      • Семейство Phallaceae — Весёлковые, или Фаллюсовые
    • Порядок Polyporales — Полипоровые, или Трутовиковые
      • Семейство Cystostereaceae — Цистостереовые
      • Семейство Fomitopsidaceae — Фомитопсидовые
      • Семейство Ganodermataceae — Ганодермовые
      • Семейство Grammotheleaceae — Граммотелеевые
      • Семейство Limnoperdaceae — Лимнопердовые
      • Семейство Meripilaceae — Мерипиловые
      • Семейство Meruliaceae — Мерулиевые
      • Семейство Phanerochaetaceae — Фанерохетовые
      • Семейство Polyporaceae — Полипоровые, или Трутовиковые
      • Семейство Sparassidaceae — Спарассовые
      • Семейство Tubulicrinaceae
      • Семейство Xenasmataceae — Ксенасмовые
    • Порядок Russulales — Руссуловые, или Сыроежковые
      • Семейство Albatrellaceae — Альбатрелловые
      • Семейство Amylostereaceae — Амилостереовые
      • Семейство Auriscalpiaceae — Аурискальпиевые
      • Семейство Bondarzewiaceae — Бондарцевиевые
      • Семейство Echinodontiaceae — Эхинодонтиевые
      • Семейство Hericiaceae — Герициевые
      • Семейство Hybogasteraceae — Гибогастеровые
      • Семейство Lachnocladiaceae — Лахнокладиевые
      • Семейство Peniophoraceae — Пениофоровые
      • Семейство Russulaceae — Руссуловые, или Сыроежковые
      • Семейство Stephanosporaceae — Стефаноспоровые
      • Семейство Stereaceae — Стереовые
    • Порядок Sebacinales — Себациновые
      • Семейство Sebacinaceae
    • Порядок Thelephorales — Телефоровые
      • Семейство Bankeraceae — Банкеровые
      • Семейство Thelephoraceae — Телефоровые
    • Порядок Trechisporales — Трехиспоровые
      • Семейство Hydnodontaceae — Гиднодонтовые

Классы Agaricostilbomycetes — Entorrhizomycetes

• • Класс Agaricostilbomycetes — Агарикостильбомицеты
    • Порядок Agaricostilbales — Агарикостильбовые
      • Семейство Agaricostilbaceae
      • Семейство Chionosphaeraceae — Хионосферовые
      • Семейство Kondoaceae — Кондовые
    • Порядок Spiculogloeales — Спикулоглеевые
  • Класс Atractiellomycetes — Атрактиелломицеты
    • Порядок Atractiellales — Атрактиелловые
      • Семейство Atractogloeaceae — Атрактоглеевые
      • Семейство Mycogelidiaceae — Микогелидиевые
      • Семейство Phleogenaceae — Флеогеновые
  • Класс Classiculomycetes — Классикуломицеты
    • Порядок Classiculales — Классикуловые
      • Семейство Classiculaceae
  • Класс Cryptomycocolacomycetes — Криптомикоколакомицеты
    • Порядок Cryptomycocolacales — Криптомикоколаковые
      • Семейство Cryptomycocolacaceae
  • Класс Cystobasidiomycetes — Цистобазидиомицеты
    • Порядок Cystobasidiales — Цистобазидиевые
      • Семейство Cystobasidiaceae
    • Порядок Erythrobasidiales — Эритробазидиевые
    • Порядок Naohideales
  • Класс Dacrymycetes — Дакримицеты
    • Порядок Dacrymycetales — Дакримицетовые
      • Семейство Dacrymycetaceae — Дакримицетовые
  • Класс Entorrhizomycetes — Энторизомицеты
    • Порядок Entorrhizales — Энторизовые
      • Семейство Entorrhizaceae

Классы Exobasidiomycetes — Pucciniomycetes

• • Класс Exobasidiomycetes — Экзобазидиомицеты
    • Порядок Ceraceosorales — Церацеосоровые
    • Порядок Doassansiales — Доассаниевые
      • Семейство Doassansiaceae
      • Семейство Melaniellaceae — Меланиелловые
      • Семейство Rhamphosporaceae — Рамфоспоровые
    • Порядок Entylomatales — Энтиломовые
      • Семейство Entylomataceae
    • Порядок Exobasidiales — Экзобазидиальные
      • Семейство Brachybasidiaceae — Брахибазидиевые
      • Семейство Cryptobasidiaceae — Криптобазидиевые
      • Семейство Exobasidiaceae — Экзобазидиевые
      • Семейство Graphiolaceae — Графиоловые
    • Порядок Georgefischeriales
      • Семейство Eballistraceae — Эбаллистровые
      • Семейство Georgefischeriaceae
      • Семейство Gjaerumiaceae — Йерумиевые
      • Семейство Tilletiariaceae — Тиллециариевые
    • Порядок Microstromatales — Микростромовые
      • Семейство Microstromataceae
      • Семейство Quambalariaceae — Камбалариевые
      • Семейство Volvocisporiaceae — Вольвоциспориевые
    • Порядок Tilletiales — Тиллециевые
      • Семейство Tilletiaceae
  • Класс Microbotryomycetes — Микроботриомицеты
    • Порядок Heterogastridiales — Гетерогастридиевые
      • Семейство Heterogastridiaceae
    • Порядок Leucosporidiales — Лейкоспоридиевые
      • Семейство Leucosporidiaceae
    • Порядок Microbotryales — Микроботриевые
      • Семейство Microbotryaceae
      • Семейство Ustilentylomataceae — Устилентиломовые
    • Порядок Sporidiobolales — Споридиоболовые
      • Семейство Sporidiobolaceae
  • Класс Mixiomycetes — Миксиомицеты
    • Порядок Mixiales — Миксиевые
      • Семейство Mixiaceae
  • Класс Pucciniomycetes — Пукциниомицеты
    • Порядок Helicobasidiales — Геликобазидиевые
      • Семейство Helicobasidiaceae
    • Порядок Pachnocybales — Пахноцибовые
      • Семейство Pachnocybaceae
    • Порядок Platygloeales — Платиглеевые
      • Семейство Eocronartiaceae — Эокронарциевые
      • Семейство Platygloeaceae
      • Семейство Saccoblastiaceae — Саккобластиевые
    • Порядок Pucciniales — Пукциниевые, или Ржавчинные грибы
      • Семейство Chaconiaceae — Хакониевые
      • Семейство Coleosporiaceae — Кониоспориевые
      • Семейство Cronartiaceae — Кронарциевые
      • Семейство Melampsoraceae — Мелампсоровые
      • Семейство Mikronegeriaceae — Микронегериевые
      • Семейство Phakopsoraceae — Факоспоровые
      • Семейство Phragmidiaceae — Фрагмидиевые
      • Семейство Pileolariaceae — Пилеолариевые
      • Семейство Pucciniaceae — Пукциниевые
      • Семейство Pucciniastraceae — Пукциниастровые
      • Семейство Pucciniosiraceae — Пукциниосировые
      • Семейство Raveneliaceae — Равенелиевые
      • Семейство Uncolaceae — Унколовые
      • Семейство Uropyxidaceae — Уропиксидовые
    • Порядок Septobasidiales — Септобазидиевые
      • Семейство Septobasidiaceae

Классы Tremellomycetes — Wallemiomycetes

• • Класс Tremellomycetes — Тремелломицеты
    • Порядок Cystofilobasidiales — Цистофилобазидиевые
      • Семейство Cystofilobasidiaceae
    • Порядок Filobasidiales — Филобазидиевые
      • Семейство Filobasidiaceae
    • Порядок Tremellales — Тремелловые, или Дрожалковые
      • Семейство Carcinomycetaceae — Карциномицетовые
      • Семейство Cuniculitremaceae — Куникулитремовые
      • Семейство Hyaloriaceae — Гиалориевые
      • Семейство Phragmoxenidiaceae — Фрагмоксенидиевые
      • Семейство Rhynchogastremataceae — Ринхогастремовые
      • Семейство Sirobasidiaceae — Сиробазидиевые
      • Семейство Tetragoniomycetaceae — Тетрагониомицетовые
      • Семейство Tremellaceae — Тремелловые, или Дрожалковые
      • Семейство Trichosporonaceae — Трихоспороновые
  • Класс Ustilaginomycetes — Устилягиномицеты
    • Порядок Urocystidiales — Уроцистидиевые
      • Семейство Doassansiopsidaceae — Доассаниопсидовые
      • Семейство Glomosporiaceae — Гломоспориевые
      • Семейство Mycosyringaceae — Микосиринговые
      • Семейство Urocystidaceae — Уроцистидовые
    • Порядок Ustilaginales — Головнёвые
      • Семейство Anthracoideaceae — Антракоидные
      • Семейство Cintractiellaceae — Цинтрактиелловые
      • Семейство Clintamraceae — Клинтамровые
      • Семейство Geminaginaceae
      • Семейство Melanotaeniaceae — Меланотениевые
      • Семейство Uleiellaceae — Улейелловые
      • Семейство Ustilaginaceae — Устилаговые
      • Семейство Websdaneaceae
  • Класс Wallemiomycetes — Валлемиомицеты
    • Порядок Wallemiales — Валлемиевые
      • Семейство Wallemiaceae

Порядки базидиомицетов, не отнесённые к классам

• • • Malasseziales

Отдел Blastocladiomycota

• Отдел Blastocladiomycota — Бластокладиомикота
  • Класс Blastocladiomycetes — Бластокладиомицеты
    • Порядок Blastocladiales — Бластокладиевые
      • Семейство Blastocladiaceae
      • Семейство Catenariaceae — Катенариевые
      • Семейство Coelomomycetaceae — Целомомицетовые
      • Семейство Physodermataceae — Физодермовые
      • Семейство Sorochytriaceae — Сорохитриевые

Отдел Chytridiomycota

• Отдел Chytridiomycota — Хитридиомикота
  • Класс Chytridiomycetes — Хитридиомицеты
    • Порядок Chytridiales — Хитридиевые
      • Семейство Chytridiaceae
      • Семейство Cladochytriaceae — Кладохитриевые
      • Семейство Endochytriaceae — Эндохитриевые
      • Семейство Synchytriaceae — Синхитриевые
    • Порядок Rhizophlyctidales — Ризофликтидовые
      • Семейство Rhizophlyctidaceae
    • Порядок Rhizophydiales — Ризофидиевые
      • Семейство Aquamycetaceae — Аквамицетовые
      • Семейство Globomycetaceae — Глобомицетовые
      • Семейство Kappamycetaceae — Каппамицетовые
      • Семейство Rhizophydiaceae
      • Семейство Terramycetaceae — Террамицетовые
    • Порядок Spizellomycetales
      • Семейство Caulochytriaceae — Каулохитриевые
      • Семейство Spizellomycetaceae
    • Семейства класса Chytridiomycetes, не отнесённые к порядкам:
      • Olpidiaceae — Ольпидиевые
  • Класс Monoblepharidomycetes — Моноблефаридомицеты
    • Порядок Monoblepharidales — Моноблефаридовые
      • Семейство Gonapodyaceae — Гонаподиевые
      • Семейство Harpochytriaceae — Гарпохитриевые
      • Семейство Monoblepharidaceae
      • Семейство Oedogoniomycetaceae — Эдогониомицетовые

Отделы Glomeromycota, Microspora, Neocallimastigomycota

• Отдел Glomeromycota — Гломеромикота — бывш. порядок класса Zygomycetes
  • Класс Glomeromycetes — Гломеромицеты^[6]
    • Порядок Archaeosporales — Археоспоровые
      • Семейство Ambisporaceae — Амбиспоровые
      • Семейство Archaeosporaceae
      • Семейство Geosiphonaceae — Геосифоновые
    • Порядок Diversisporales — Диверсиспоровые
      • Семейство Acaulosporaceae — Акаулоспоровые
      • Семейство Diversisporaceae
      • Семейство Gigasporaceae — Гигаспоровые
      • Семейство Pacisporaceae — Пациспоровые
    • Порядок Glomerales — Гломовые
      • Семейство Glomeraceae
    • Порядок Paraglomerales — Парагломовые
      • Семейство Paraglomeraceae

• Отдел Microspora — Микроспоридии^[6]
  • Класс Microsporea
    • Порядок Chytridiopsida
      • Семейство Chytridiopsidae
    • Порядок Microsporida
      • Семейство Enterocytozoonidae
      • Семейство Glugeidae
      • Семейство Nosematidae
      • Семейство Pleistophoridae
      • Семейство Thelohaniidae

• Отдел Neocallimastigomycota — Неокаллимастигомикота — бывш. порядок класса Chytridiomycota
  • Класс Neocallimastigomycetes — Неокаллимастигомицеты
    • Порядок Neocallimastigales — Неокаллимастиговые
      • Семейство Neocallimastigaceae

Отдел Zygomycota

• Отдел Zygomycota — Зигомикота
  • Классы не определены
    • Порядок Asellariales — Аселлариевые
      • Семейство Asellariaceae
    • Порядок Basidiobolales — Базидиоболовые
      • Семейство Basidiobolaceae
    • Порядок Dimargaritales — Димаргаритовые^[6]
      • Семейство Dimargaritaceae
    • Порядок Endogonales — Эндогоновые
      • Семейство Endogonaceae
    • Порядок Entomophthorales — Энтомофторовые
      • Семейство Ancylistaceae — Анциллистовые
      • Семейство Completoriaceae — Комплеториевые
      • Семейство Entomophthoraceae — Энтомофторовые
      • Семейство Meristacraceae — Меристакровые
      • Семейство Neozygitaceae — Неозигитовые
    • Порядок Harpellales — Харпелловые
      • Семейство Harpellaceae
      • Семейство Legeriomycetaceae — Легериомицетовые
    • Порядок Kickxellales — Кикселловые^[6]
      • Семейство Kickxellaceae
    • Порядок Mortierellales
      • Семейство Mortierellaceae
    • Порядок Mucorales — Мукоровые
      • Семейство Choanephoraceae — Хоанефоровые
      • Семейство Cunninghamellaceae — Куннингамелловые
      • Семейство Mucoraceae — Мукоровые
      • Семейство Mycotyphaceae — Микотифовые
      • Семейство Phycomycetaceae — Фикомицетовые
      • Семейство Pilobolaceae — Пилоболовые
      • Семейство Radiomycetaceae — Радиомицетовые
      • Семейство Syncephalastraceae — Синцефаластровые
      • Семейство Umbelopsidaceae — Умбеллопсидовые
    • Порядок Zoopagales — Зоопаговые
      • Семейство Cochlonemataceae — Кохлонемовые
      • Семейство Helicocephalidaceae — Геликоцефалисовые
      • Семейство Piptocephalidaceae — Пиптоцефалисовые^[6]
      • Семейство Sigmoideomycetaceae — Сигмоидеомицетовые
      • Семейство Zoopagaceae

Царство Protozoa

• Отдел (тип) Choanozoa — порядки, перенесённые из Zygomycota (бывш. в классе Trichomycetes)
  • Класс Mesomycetozoea
    • Порядок Amoebidiales — Амебидовые
      • Семейство Amoebidiaceae
    • Порядок Eccrinales — Эккриновые
      • Семейство Eccrinaceae
      • Семейство Palavasciaceae
      • Семейство Parataeniellaceae
• Отдел (тип) Cercozoa — Церкозоа^[6]
  • Класс Phytomyxea
    • Порядок Plasmodiophorida — Плазмодиофоровые [syn. Plasmodiophoromycota]^[6]
      • Семейство Endemosarcaceae
      • Семейство Plasmodiophoraceae — Плазмодиофоровые
• Отдел (тип) Labyrinthista
  • Класс Labyrinthulea
    • Порядок Dassellarina
      • Cемейство Eucyrtidiidae
      • Cемейство Stethopiliidae
    • Порядок Phaeodaria
      • Cемейство Aulacanthidae
    • Порядок Piroplasmida
      • Cемейство Heterophyridae
      • Cемейство Raphidiophyidae
• Отдел (тип) Mycetozoa [syn. Myxomycota — Миксомицеты]^[14]
  • Класс Acrasiomycetes — Акразиевые
    • Порядок Acrasiales — Акразиевые
      • Семейство Acrasiaceae
  • Класс Dictyosteliomycetes — Диктиостелиевые [syn. Dictyosteliomycota — отдел Диктиостелиевые]
    • Порядок Dictyosteliales — Диктиостелиевые
      • Семейство Acytosteliaceae — Ацитостелиевые
      • Семейство Dictyosteliaceae — Диктиостелиевые
  • Класс Myxomycetes — Миксомицеты, или собственно слизевики [syn. Myxogasteromycetes — Миксогастровые]
    • Порядок Echinosteliales — Эхиностелиевые
      • Семейство Clastodermataceae — Кластодермовые
      • Семейство Echinosteliaceae
    • Порядок Liceales — Лицеевые
      • Семейство Cribrariaceae — Крибрариевые
      • Семейство Dictydiaethaliaceae — Диктидиэталиевые
      • Семейство Liceaceae — Лицеевые
      • Семейство Listerellaceae — Листерелловые
      • Семейство Tubiferaceae — Тубиферовые
    • Порядок Physarales — Физаровые
      • Семейство Didyamiaceae — Дидиамиевые
      • Семейство Didymiaceae — Дидимиевые
      • Семейство Elaeomyxaceae — Элеомиксовые
      • Семейство Physaraceae — Физаровые
    • Порядок Stemonitales — Стемонитовые
      • Семейство Stemonitidacea
      • Семейство Stemonitidaceae — Стемонитовые
    • Порядок Trichiales — Трихиевые
      • Семейство Arcyriaceae — Арцириевые
      • Семейство Dianemataceae — Дианемовые
      • Семейство Trichiaceae — Трихиевые
  • Класс Protosteliomycetes — Протостелиевые
    • Порядок Protosteliales — Протостелиевые
      • Семейство Cavosteliaceae — Кавостелиевые
      • Семейство Ceratiomyxaceae — Цератомиксовые
      • Семейство Echinosteliopsidaceae — Эхиностелиопсидовые
      • Семейство Protosteliaceae — Протостелиевые

Примечания