Lt304888.ru

Туристические услуги

IRES

21-10-2023

Геном полиовируса, включающий IRES.

IRES — участок внутренней посадки рибосомы (русская аббревиатура практически не используется, более распространена англ. IRES, Internal Ribosome Entry Site) — последовательность нуклеотидов в мРНК, обеспечивающая инициацию трансляции в эукариотических клетках без сканирования большей части 5'-нетранслируемой области, как это имеет место для большинства клеточных мРНК.

История

Участки внутренней посадки рибосомы были открыты в мРНК полиовируса и вируса энцефаломиокардита в 1988 году группами Н.Соненберга[1] и Э.Виммера[2]. Оказалось, что если поместить IRES между двумя репортёрными генами в мРНК, то второй (3'-концевой) цистрон также будет экспрессироваться. Однако использование данного метода (т. н. метода бицистронных конструкций) может привести к ряду артефактов, связанных со сплайсингом и потенциальной промоторной активностью сайтов внутренней посадки рибосомы[3].

Механизм

IRESы обнаружены в 5'-нетранслируемых областях геномных мРНК вирусов и позволяют им транслироваться независимо от кэпа. Ряд клеточных мРНК также может содержать IRESы [4]. К ноябрю 2005 года было известно около 50 содержащих IRESы вирусов и около 73 мРНК [5].

Следует иметь в виду, что многие вирусные мРНК имеют на своём 5'-конце ковалентно связанный белок (VpG), поэтому использование кэп-зависимой инициации для них исключено. Более того, ряд их был изучен весьма подробно. Так было показано, что IRESы группы вируса гепатита С связывают 40S рибосомную субчастицу таким образом, что инициаторный кодон мРНК оказывается непосредственно в Р-участке рибосомы без какого-либо сканирования мРНК. IRESы многих пикорнавирусов не связывают 40S напрямую, а делают это через фактор инициации 4G, высокоафинный сайт связывания которого находится в IRESе [6].

Литература

  1. 10.1038/334320a0. PMID 2839775.
  2. A segment of the 5' nontranslated region of encephalomyocarditis virus RNA directs internal entry of ribosomes during in vitro translation». J Virol. 62: 2636—2643. PMID 2839690.
  3. A second look at cellular mRNA sequences said to function as internal ribosome entry sites». Nucleic Acids Res. 33 (20): 6593—6602. 10.1093/nar/gki958. PMID 16314320.
  4. http://www.sciencedirect.com/science?_ob=ArticleURL&_udi=B8JH3-4WV15YK-1&_user=10&_rdoc=1&_fmt=&_orig=search&_sort=d&_docanchor=&view=c&_acct=C000050221&_version=1&_urlVersion=0&_userid=10&md5=627335c5aa0811da804980f62baae8ee Обзор
  5. IRESite: Page home
  6. Internal ribosome entry sites in eukaryotic mRNA molecules — Genes & Development


IRES.

© 2020–2023 lt304888.ru, Россия, Волжский, ул. Больничная 49, +7 (8443) 85-29-01